More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3200 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  33.14 
 
 		 1874 aa  1016    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1979 aa  4079    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  42.38 
 
 		 996 aa  158  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1042 aa  154  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  40.2 
 
 		 1023 aa  152  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  42.03 
 
 		 1116 aa  152  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  43.72 
 
 		 1132 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  40.57 
 
 		 1050 aa  149  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  43 
 
 		 1017 aa  149  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  37.38 
 
 		 1062 aa  149  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  39.66 
 
 		 1028 aa  149  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  40.78 
 
 		 1045 aa  148  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  40.1 
 
 		 979 aa  147  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1051 aa  147  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  43.24 
 
 		 988 aa  147  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  39.51 
 
 		 1030 aa  146  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  40.29 
 
 		 994 aa  146  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  42.74 
 
 		 1155 aa  145  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 999 aa  145  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1161 aa  145  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  42.72 
 
 		 975 aa  145  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  40.19 
 
 		 993 aa  144  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  40.47 
 
 		 1163 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  42.57 
 
 		 1053 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  41.55 
 
 		 1059 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  40.1 
 
 		 1006 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  42.11 
 
 		 1077 aa  143  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  46.05 
 
 		 1012 aa  143  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 1037 aa  142  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  41.75 
 
 		 1082 aa  142  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1062 aa  142  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 993 aa  141  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1110 aa  141  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  39.37 
 
 		 1081 aa  141  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1202 aa  141  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  41.12 
 
 		 1076 aa  140  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  40.29 
 
 		 1010 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  37.45 
 
 		 1077 aa  140  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  42.65 
 
 		 1124 aa  140  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  41.55 
 
 		 1087 aa  140  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  40.65 
 
 		 1013 aa  139  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  39.9 
 
 		 1023 aa  139  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 1026 aa  140  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  39.57 
 
 		 1129 aa  139  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  33.76 
 
 		 1063 aa  139  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  40.29 
 
 		 1006 aa  139  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  36.44 
 
 		 1051 aa  139  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 1063 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  33.1 
 
 		 1150 aa  139  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  40.71 
 
 		 1037 aa  139  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  41.83 
 
 		 1127 aa  138  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1066 aa  138  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  37.38 
 
 		 1051 aa  138  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  39.61 
 
 		 1062 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  43 
 
 		 1137 aa  137  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  41.75 
 
 		 1105 aa  137  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  40.28 
 
 		 1119 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 1050 aa  137  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  37.16 
 
 		 1027 aa  137  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  38.66 
 
 		 1035 aa  137  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  37.72 
 
 		 1041 aa  136  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  38.76 
 
 		 1023 aa  137  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  42.56 
 
 		 1004 aa  137  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  38.57 
 
 		 1097 aa  136  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  41.01 
 
 		 1155 aa  136  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 1034 aa  137  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  36.09 
 
 		 1160 aa  136  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  39.48 
 
 		 1152 aa  136  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 		 1168 aa  135  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  41.83 
 
 		 1106 aa  135  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1085 aa  135  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  38.1 
 
 		 1154 aa  135  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 1122 aa  135  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  38.79 
 
 		 1038 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  39.37 
 
 		 1079 aa  135  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  38.73 
 
 		 1064 aa  135  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 1008 aa  135  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  42.51 
 
 		 1080 aa  134  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1036 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  38.32 
 
 		 976 aa  134  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  37.87 
 
 		 1038 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 1189 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1084 aa  134  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  39.42 
 
 		 989 aa  134  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 1066 aa  134  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  39.61 
 
 		 1047 aa  134  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 1012 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 1038 aa  134  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  41.78 
 
 		 1083 aa  133  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1154 aa  133  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  41.06 
 
 		 1046 aa  133  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  36.48 
 
 		 1039 aa  134  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 1101 aa  133  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  41.63 
 
 		 1096 aa  133  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 1037 aa  133  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  42.44 
 
 		 1146 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  39.42 
 
 		 1128 aa  132  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  40.93 
 
 		 1181 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 1080 aa  132  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  39.61 
 
 		 1039 aa  132  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>