More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4463 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  39.9 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  44.38 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  38.83 
 
 		 219 aa  95.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 289 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  43.15 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  41.45 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  65.52 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  64.91 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  64.41 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  34.68 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  53.23 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  49.3 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  58.18 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  59.26 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  52.54 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  35.63 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14710  transcriptional regulator, tetR family  39.29 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0751499  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  35.86 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>