121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1050 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 318 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  62.07 
 
 		 326 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  61.76 
 
 		 328 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  61.13 
 
 		 321 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  60.62 
 
 		 322 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  61.13 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  39.12 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  33.61 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.05 
 
 		 668 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.51 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  29.51 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.86 
 
 		 930 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.21 
 
 		 831 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  29.93 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.04 
 
 		 676 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  27.14 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  33.63 
 
 		 211 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  29.8 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25.7 
 
 		 588 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.2 
 
 		 491 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.82 
 
 		 1293 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.42 
 
 		 579 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  31.3 
 
 		 627 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  33.73 
 
 		 709 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  34.76 
 
 		 522 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  34.13 
 
 		 752 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  28.48 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  26.98 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.6 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.93 
 
 		 372 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25.87 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  34.32 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  24.92 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  27.14 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  26.27 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30.81 
 
 		 384 aa  85.9  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  24.92 
 
 		 930 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.06 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  34.76 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  24.43 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.68 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  26.52 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1163 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  27.19 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.77 
 
 		 1146 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1030 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.7 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  26.12 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.54 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  29.07 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  26.9 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  23.51 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  27.95 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  26.55 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.25 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.42 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1750 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1026 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  24.64 
 
 		 786 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.17 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  29.47 
 
 		 1140 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  29.12 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1230 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  43.42 
 
 		 1068 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.33 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  30.33 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25.77 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  27.83 
 
 		 660 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.9 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1177 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  26.4 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.19 
 
 		 963 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.78 
 
 		 1130 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  29.67 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  31.71 
 
 		 937 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 		 906 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15206  peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase-like protein  26.47 
 
 		 774 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.002705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  29.56 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 2296 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 		 719 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.16 
 
 		 747 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1839  NHL repeat-containing protein  34.44 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.891916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  24.35 
 
 		 805 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  23.5 
 
 		 892 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1351 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  24.88 
 
 		 405 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  25.29 
 
 		 899 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1051 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 807 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  25.1 
 
 		 646 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.09 
 
 		 1292 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 683 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.48 
 
 		 693 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  25.9 
 
 		 898 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  24.6 
 
 		 913 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>