279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_B3754 on replicon NC_007349
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  100 
 
 		 1830 aa  3674    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  48.53 
 
 		 2636 aa  269  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  41.12 
 
 		 1779 aa  160  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1702  hypothetical protein  32.79 
 
 		 596 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.32 
 
 		 1275 aa  113  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  53.12 
 
 		 3295 aa  113  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  60.2 
 
 		 2554 aa  104  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  57.61 
 
 		 1732 aa  102  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  47.83 
 
 		 910 aa  99  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  64.1 
 
 		 978 aa  98.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  49.59 
 
 		 1439 aa  97.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  62.82 
 
 		 1682 aa  97.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  58.43 
 
 		 930 aa  96.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  54.74 
 
 		 460 aa  96.3  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  52.94 
 
 		 940 aa  95.5  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  55.43 
 
 		 2122 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  39.87 
 
 		 735 aa  94  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  56.44 
 
 		 1236 aa  94.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  55.56 
 
 		 2552 aa  94  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  41.09 
 
 		 861 aa  93.2  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  59.26 
 
 		 669 aa  92.8  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  53.06 
 
 		 1120 aa  91.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  55.43 
 
 		 1356 aa  91.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  61.25 
 
 		 848 aa  92  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  52.04 
 
 		 581 aa  91.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  54.26 
 
 		 675 aa  90.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  53.06 
 
 		 184 aa  90.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  50 
 
 		 528 aa  91.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  46.09 
 
 		 1241 aa  90.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  45.67 
 
 		 958 aa  90.5  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  60 
 
 		 1667 aa  89.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  46.27 
 
 		 752 aa  90.1  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  51.02 
 
 		 713 aa  89.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  51.4 
 
 		 1969 aa  89.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  57.32 
 
 		 547 aa  89.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  57.5 
 
 		 519 aa  89.4  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  55.32 
 
 		 658 aa  89.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  49.49 
 
 		 859 aa  89.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  48.62 
 
 		 769 aa  89  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  50.54 
 
 		 530 aa  89  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  57.32 
 
 		 2272 aa  88.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.87 
 
 		 1862 aa  88.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  56.67 
 
 		 1387 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  47.96 
 
 		 1931 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  58.14 
 
 		 615 aa  87.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  50.47 
 
 		 2036 aa  87.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  44.92 
 
 		 1842 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  49.53 
 
 		 1882 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  47.83 
 
 		 551 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  54.02 
 
 		 823 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  56.1 
 
 		 575 aa  87.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.65 
 
 		 963 aa  87.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  58.23 
 
 		 679 aa  87  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  56.04 
 
 		 1300 aa  87  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  55.42 
 
 		 1282 aa  87  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  41.84 
 
 		 2000 aa  86.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  56.79 
 
 		 791 aa  86.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  47.78 
 
 		 2065 aa  86.7  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  56.96 
 
 		 1094 aa  85.5  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  47.96 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  53.01 
 
 		 561 aa  85.5  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  55.7 
 
 		 644 aa  85.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  55.56 
 
 		 561 aa  84.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  49.45 
 
 		 786 aa  82.8  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  48.96 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  51.06 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  45.92 
 
 		 1528 aa  82.4  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  32.82 
 
 		 1361 aa  82  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  54.12 
 
 		 840 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  51.16 
 
 		 408 aa  82  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  51.52 
 
 		 1667 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  47.92 
 
 		 1311 aa  82  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  56.25 
 
 		 719 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  42.99 
 
 		 400 aa  81.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  42.06 
 
 		 1056 aa  79.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  41.96 
 
 		 500 aa  79.7  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.78 
 
 		 594 aa  79.7  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  40.3 
 
 		 725 aa  79.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  37.5 
 
 		 1095 aa  79.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  49.45 
 
 		 1783 aa  78.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  48.28 
 
 		 465 aa  78.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  47.19 
 
 		 838 aa  78.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  37.66 
 
 		 810 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  52.04 
 
 		 930 aa  77.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  34.16 
 
 		 960 aa  77.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  51.95 
 
 		 819 aa  77.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  44.9 
 
 		 938 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  49.37 
 
 		 816 aa  77.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  52.33 
 
 		 870 aa  77  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  47.19 
 
 		 1001 aa  76.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  52.56 
 
 		 941 aa  76.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  56.16 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  42.48 
 
 		 1189 aa  75.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  47.31 
 
 		 1231 aa  75.5  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  44 
 
 		 1092 aa  75.5  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  28.09 
 
 		 1328 aa  74.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  52.33 
 
 		 802 aa  74.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  50 
 
 		 869 aa  75.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  29.94 
 
 		 865 aa  74.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  51.19 
 
 		 1531 aa  74.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>