230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14190 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  100 
 
 		 511 aa  972    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  57.65 
 
 		 481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  55.84 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 		 487 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  50.32 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  48.73 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  47.67 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  51.37 
 
 		 466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  47.27 
 
 		 473 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  44.82 
 
 		 484 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  48.52 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  47.79 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  47.56 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  42.68 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  47.71 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  49.37 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  39.87 
 
 		 476 aa  372  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  48.74 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  43.04 
 
 		 478 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  41.77 
 
 		 476 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  50.63 
 
 		 477 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  46.03 
 
 		 479 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  43.01 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  48.63 
 
 		 505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  50.21 
 
 		 474 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  45.55 
 
 		 482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 487 aa  320  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  50.63 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 491 aa  316  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.09 
 
 		 503 aa  316  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  51.27 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  41.99 
 
 		 496 aa  312  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  43.83 
 
 		 482 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.09 
 
 		 499 aa  309  9e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  42.49 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  42.49 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  44.51 
 
 		 491 aa  302  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  42.12 
 
 		 476 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  40.85 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  41.77 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  43.92 
 
 		 524 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  43.22 
 
 		 437 aa  283  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 		 534 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 560 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.45 
 
 		 545 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 568 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 534 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 526 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 580 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 528 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  35.55 
 
 		 530 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.02 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 510 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 523 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 523 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.96 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 554 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 531 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  31.93 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  30.08 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 528 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 547 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 551 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.13 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 545 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 522 aa  90.9  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.77 
 
 		 545 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 549 aa  88.6  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.76 
 
 		 533 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.47 
 
 		 527 aa  87  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 561 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.46 
 
 		 564 aa  86.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.99 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 536 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  30.9 
 
 		 532 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.75 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 532 aa  83.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 530 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  30.71 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>