More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15040 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 458 aa  948    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  35.18 
 
 		 431 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  34.62 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4716  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 432 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 411 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.94 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  22.99 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 436 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.51 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.46 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.58 
 
 		 407 aa  97.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 437 aa  96.7  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  24.11 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.82 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  20.84 
 
 		 399 aa  94  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.29 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 419 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 455 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 440 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 392 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 392 aa  91.3  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 391 aa  90.5  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 391 aa  90.5  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 435 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 395 aa  87.8  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 424 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  21.81 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  21.81 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.68 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.78 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  22.55 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  21.67 
 
 		 440 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  24.48 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.28 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 420 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.98 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  33.56 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.61 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>