More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3008 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 280 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 208 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 229 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  40.16 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  41.73 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  27.72 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  42.17 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  42.25 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 188 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 205 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  41.43 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 199 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  29.17 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  58.33 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>