86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0536 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 748 aa  1520    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 705 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 827 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 820 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 817 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 725 aa  183  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 805 aa  180  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 847 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 705 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 805 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 611 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 813 aa  160  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 818 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 794 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 883 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 820 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 806 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 816 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.45 
 
 		 709 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 897 aa  147  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 795 aa  140  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 814 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 813 aa  134  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 793 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 799 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 808 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 830 aa  125  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 824 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 822 aa  121  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.48 
 
 		 894 aa  119  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 791 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 826 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 821 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 766 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 810 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 973 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.1 
 
 		 805 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 832 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.87 
 
 		 815 aa  108  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 818 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 866 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 		 800 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 812 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 813 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 869 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 852 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 810 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 803 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 829 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 802 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 817 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  26.15 
 
 		 782 aa  94.7  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 934 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 828 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 812 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  23.51 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.11 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 814 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 804 aa  71.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 819 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 853 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3318  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  34.12 
 
 		 954 aa  54.3  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0120017  decreased coverage  0.00000382692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  38.75 
 
 		 924 aa  53.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 746 aa  51.6  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 823 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 998 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.78 
 
 		 972 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 938 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0251  hypothetical protein  25.16 
 
 		 692 aa  48.5  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.614508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 946 aa  48.5  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 842 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  23.98 
 
 		 926 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1003 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 918 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  25.79 
 
 		 838 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 922 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 714 aa  45.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  25.93 
 
 		 920 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  33.9 
 
 		 927 aa  45.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2547  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 924 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000166222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  22.66 
 
 		 921 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 958 aa  45.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2242  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 950 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  23.31 
 
 		 930 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  33.67 
 
 		 630 aa  44.3  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.02 
 
 		 946 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>