10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0251 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0251  hypothetical protein  100 
 
 		 692 aa  1429    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.614508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 725 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 813 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 748 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  20.49 
 
 		 824 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  22.63 
 
 		 804 aa  47.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 791 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  20.84 
 
 		 818 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 810 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 805 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>