More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1413 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  41.91 
 
 		 1135 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  57.16 
 
 		 1038 aa  1197    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  48.23 
 
 		 1138 aa  1040    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1165 aa  2375    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  60.74 
 
 		 1073 aa  1259    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1142 aa  683    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  40.16 
 
 		 1022 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  39.13 
 
 		 1063 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  37.2 
 
 		 1153 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  56.55 
 
 		 1043 aa  1186    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  35.43 
 
 		 1147 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  36.29 
 
 		 1033 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  36.36 
 
 		 1051 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1059 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  36.74 
 
 		 1036 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  36.24 
 
 		 1032 aa  563  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1129 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 1105 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 1093 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1065 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1031 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.05 
 
 		 1058 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1169 aa  486  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1189 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1051 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  33.21 
 
 		 1065 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.62 
 
 		 1028 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1074 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1127 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1040 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.9 
 
 		 1071 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 1234 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1067 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1038 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1063 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1163 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1081 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1087 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 1166 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1059 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1059 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1033 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1072 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1041 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1088 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1101 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1071 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  31.64 
 
 		 1010 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1043 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1153 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1081 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1068 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 1039 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1176 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 1098 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.26 
 
 		 1083 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1081 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 1050 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1071 aa  400  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1099 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1064 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1098 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1047 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1138 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1011 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1186 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1073 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1102 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1107 aa  360  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1137 aa  358  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1078 aa  358  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1115 aa  351  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1044 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1027 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1155 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1088 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1148 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1097 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1114 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1144 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.17 
 
 		 1025 aa  302  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1008 aa  301  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1117 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 1177 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1096 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1168 aa  282  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 1189 aa  277  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1084 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1106 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1057 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.25 
 
 		 1177 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1116 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1146 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1122 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1050 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1109 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1128 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 1090 aa  257  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1040 aa  257  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1066 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>