159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2946 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  985    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  32.99 
 
 		 456 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  32.65 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  30.48 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  30.82 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  31.75 
 
 		 459 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  29.85 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  30.02 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  31.24 
 
 		 484 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  31.34 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  30.6 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  30.22 
 
 		 476 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  26.62 
 
 		 450 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  30.22 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  28.92 
 
 		 474 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  26.51 
 
 		 466 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  27.92 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  28.4 
 
 		 467 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  28.3 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.73 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  31.64 
 
 		 491 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  27.97 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 456 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 504 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 462 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 461 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  22.38 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.78 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3748  hypothetical protein  29.39 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000795309  hitchhiker  0.0030184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  27.09 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  26.89 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  22.91 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  23.44 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.07 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.13 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.66 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  23.58 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.84 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  22.59 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 509 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 503 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  26.09 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  24.41 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  21.88 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.15 
 
 		 507 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.05 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  21.3 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.77 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  22.75 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 499 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3289  hypothetical protein  27.37 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000775168  hitchhiker  0.000534443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6807  hypothetical protein  25.09 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  hitchhiker  0.0000033476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 477 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  26.01 
 
 		 446 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 612 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>