140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1111 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  536  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0805957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1128  hypothetical protein  31.75 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.499408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1131  hypothetical protein  29.46 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.543698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1130  hypothetical protein  30.92 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.396679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 994 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  36.15 
 
 		 1146 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1119 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1145 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  37.29 
 
 		 1096 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10788  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  27.35 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1106 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1060 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1103 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3674  hypothetical protein  36.76 
 
 		 181 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1148 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1144 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1155 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1102 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 1065 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1202 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  37 
 
 		 1087 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1116 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1150 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1081 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1058 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1142 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1036 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1168 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1127 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1048 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1148 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1024 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1019 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1079 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1175 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 1100 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 1040 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1102 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1128 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1946  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1045 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1177 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1082 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1012 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 1076 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1094 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1013 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1079 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1023 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1029 aa  49.3  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1117 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1076 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1177 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1120 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1031 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1071 aa  48.5  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1142 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1059 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1047 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1188 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1155 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1075 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1026 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1128 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1119 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1161 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1109 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1051 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1138 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 1045 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 1019 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1008 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1027 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  33.64 
 
 		 1034 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1034 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1006 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1093 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 		 1087 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1125 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1160 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1104 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1064 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1114 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 993 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 984 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1105 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1020 aa  45.4  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1176 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 982 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 986 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1119 aa  45.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0983  hypothetical protein  25.14 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.533153  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1008 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1124 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1181 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1041 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1137 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>