More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3164 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  39.06 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  36.93 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  28.14 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 248 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  32.95 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  44.44 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  29.95 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  39.74 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 276 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>