More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09223 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  45.25 
 
 		 822 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 815 aa  1634    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 821 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 		 810 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 808 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 791 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 830 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 818 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  29.75 
 
 		 805 aa  321  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 802 aa  313  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 820 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 812 aa  300  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 824 aa  294  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 766 aa  293  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 829 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 813 aa  278  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 826 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 866 aa  270  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 973 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 934 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 827 aa  254  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 817 aa  251  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 869 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 832 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 800 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 804 aa  243  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 852 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 853 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 818 aa  230  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 883 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 828 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 705 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 803 aa  223  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 819 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 813 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 817 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 847 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 813 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 805 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  25.09 
 
 		 894 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 812 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 810 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 823 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 806 aa  194  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.74 
 
 		 715 aa  194  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 814 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 816 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 795 aa  184  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 814 aa  184  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 725 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 799 aa  174  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 611 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 897 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 793 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 820 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 794 aa  158  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.89 
 
 		 709 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  20.72 
 
 		 805 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 748 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  22.1 
 
 		 782 aa  108  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.52 
 
 		 961 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.2 
 
 		 924 aa  97.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 998 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  25.31 
 
 		 920 aa  88.2  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 924 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.41 
 
 		 946 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.31 
 
 		 921 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  32.53 
 
 		 833 aa  79.3  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  30.61 
 
 		 915 aa  78.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 705 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  21.22 
 
 		 872 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  26.12 
 
 		 944 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  26.92 
 
 		 929 aa  72.4  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.38 
 
 		 952 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  22.62 
 
 		 930 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  20.52 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  23.93 
 
 		 965 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 763 aa  67.8  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.3 
 
 		 926 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 753 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 861 aa  65.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 769 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  24.02 
 
 		 744 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  27.57 
 
 		 895 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  23.43 
 
 		 744 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  28.98 
 
 		 750 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 733 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.13 
 
 		 904 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 678 aa  62  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.79 
 
 		 631 aa  61.6  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 931 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  20.38 
 
 		 887 aa  61.2  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 933 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 748 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 999 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.25 
 
 		 746 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 778 aa  59.7  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.89 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.89 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  37.89 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>