114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00775 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  100 
 
 		 2364 aa  4746    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  70.13 
 
 		 1030 aa  970    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  100 
 
 		 860 aa  1734    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  25.27 
 
 		 1097 aa  150  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  31.59 
 
 		 766 aa  140  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  28.75 
 
 		 873 aa  125  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  27.91 
 
 		 774 aa  125  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  41.98 
 
 		 726 aa  119  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1634 aa  106  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  33.82 
 
 		 406 aa  97.8  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  48.89 
 
 		 3958 aa  94  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  34.19 
 
 		 6497 aa  86.3  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  45.98 
 
 		 4044 aa  84.3  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  39.08 
 
 		 5298 aa  73.2  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  38.37 
 
 		 3227 aa  67.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  32.71 
 
 		 627 aa  66.6  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  38.36 
 
 		 1371 aa  65.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  31.3 
 
 		 1466 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 429 aa  63.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  35.56 
 
 		 815 aa  63.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  28.42 
 
 		 676 aa  63.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  29.08 
 
 		 3542 aa  61.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  39.33 
 
 		 822 aa  61.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  40 
 
 		 1259 aa  60.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  35.23 
 
 		 1526 aa  60.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.43 
 
 		 2927 aa  59.7  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.49 
 
 		 2296 aa  58.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  32.98 
 
 		 2005 aa  58.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  28.29 
 
 		 2980 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  40.58 
 
 		 1059 aa  57.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  35.87 
 
 		 750 aa  57.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  30.53 
 
 		 535 aa  57.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  35.56 
 
 		 2421 aa  56.2  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  35.56 
 
 		 2454 aa  56.2  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1031 aa  55.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  32.43 
 
 		 1537 aa  55.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  35.56 
 
 		 2367 aa  55.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  35.56 
 
 		 2411 aa  55.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1193 aa  55.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1066 aa  55.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  39.73 
 
 		 2772 aa  54.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  34.29 
 
 		 637 aa  54.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1139 aa  55.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  26.85 
 
 		 967 aa  55.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  35.16 
 
 		 1230 aa  54.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  35.56 
 
 		 2807 aa  54.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  29.73 
 
 		 1389 aa  53.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.62 
 
 		 799 aa  53.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  34.83 
 
 		 1140 aa  52.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1064 aa  52.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  31.87 
 
 		 4896 aa  52.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  34.52 
 
 		 1162 aa  52  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  31.5 
 
 		 2972 aa  52.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  38.36 
 
 		 652 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  32 
 
 		 1287 aa  52.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  31.03 
 
 		 2833 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.47 
 
 		 1602 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  31.68 
 
 		 792 aa  52  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  34.15 
 
 		 3737 aa  51.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  23.46 
 
 		 4071 aa  51.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  43.28 
 
 		 774 aa  50.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  30.69 
 
 		 4429 aa  50.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1163 aa  50.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  45.61 
 
 		 778 aa  50.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  46.43 
 
 		 487 aa  50.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  20.49 
 
 		 532 aa  49.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  25.85 
 
 		 540 aa  49.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  44.64 
 
 		 734 aa  49.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  32.97 
 
 		 3793 aa  49.3  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  35.71 
 
 		 599 aa  49.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.36 
 
 		 942 aa  48.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1111 aa  48.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  38.6 
 
 		 938 aa  48.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  29.47 
 
 		 669 aa  48.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  41.67 
 
 		 852 aa  49.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  51.22 
 
 		 1057 aa  48.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.23 
 
 		 775 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  31.58 
 
 		 711 aa  48.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  32.88 
 
 		 694 aa  48.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  45.61 
 
 		 778 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  45.61 
 
 		 778 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  44 
 
 		 780 aa  48.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.82 
 
 		 3197 aa  48.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  45.61 
 
 		 778 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  34.88 
 
 		 1050 aa  47.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.25 
 
 		 818 aa  47.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  47.27 
 
 		 944 aa  47.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  47.27 
 
 		 944 aa  47.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  48.78 
 
 		 1667 aa  47.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.43 
 
 		 5745 aa  47.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.53 
 
 		 1620 aa  47.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  30.85 
 
 		 808 aa  47.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 496 aa  47.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  47.27 
 
 		 944 aa  47.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  47.27 
 
 		 944 aa  47.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  32.43 
 
 		 1441 aa  47.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.78 
 
 		 1916 aa  47  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  37.14 
 
 		 794 aa  47  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  28.87 
 
 		 2064 aa  47  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  36.76 
 
 		 885 aa  47  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>