More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2541 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  100 
 
 		 530 aa  1078    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  54.68 
 
 		 530 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  51.42 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  51.42 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  51.61 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 537 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  41.77 
 
 		 533 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  39.7 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  42.67 
 
 		 527 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 539 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 536 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 547 aa  353  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  38.07 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 		 518 aa  343  5.999999999999999e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 533 aa  335  9e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 		 535 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  37.83 
 
 		 530 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 537 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  41.29 
 
 		 532 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  41.1 
 
 		 532 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 535 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 		 532 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.23 
 
 		 536 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 552 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 534 aa  273  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 554 aa  266  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 559 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 554 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 547 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 547 aa  246  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 563 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  33.21 
 
 		 556 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 565 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 536 aa  226  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 564 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 532 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 561 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.89 
 
 		 510 aa  213  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 556 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 514 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.69 
 
 		 527 aa  190  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 528 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.41 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 533 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 519 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 		 551 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 523 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  31.79 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 523 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 531 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 520 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.71 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 527 aa  153  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 520 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 520 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  26.85 
 
 		 536 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 545 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.52 
 
 		 529 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  31.88 
 
 		 504 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 530 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.48 
 
 		 545 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 517 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 521 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 526 aa  130  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  29.6 
 
 		 516 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  27.46 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 524 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 531 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.19 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 534 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.46 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 528 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 523 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  29.39 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.86 
 
 		 523 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 534 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  28.98 
 
 		 529 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  26.19 
 
 		 465 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  27.88 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.57 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  25.29 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 560 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 557 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>