123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0544 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  58.58 
 
 
301 aa  286  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  56.25 
 
 
276 aa  275  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  53.42 
 
 
503 aa  264  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  48.94 
 
 
274 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  50 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  48.31 
 
 
286 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  42.69 
 
 
330 aa  204  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 
469 aa  191  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  43.7 
 
 
556 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  44.12 
 
 
289 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  44.58 
 
 
283 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  43.51 
 
 
423 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  42.31 
 
 
291 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.82 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  40.89 
 
 
642 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  40.89 
 
 
641 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  40 
 
 
279 aa  168  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  37.55 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.21 
 
 
627 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  36.75 
 
 
389 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.55 
 
 
358 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.21 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 
1321 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.21 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  37.13 
 
 
383 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  38.71 
 
 
426 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 
291 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  35.6 
 
 
1028 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.16 
 
 
288 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.44 
 
 
1290 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.42 
 
 
306 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 
694 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 
328 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  33.88 
 
 
883 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.13 
 
 
884 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.13 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  37.55 
 
 
409 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.51 
 
 
633 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  34.43 
 
 
1918 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.89 
 
 
532 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.21 
 
 
569 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.68 
 
 
912 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  35.69 
 
 
588 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  34.98 
 
 
275 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  32.56 
 
 
1059 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.91 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.34 
 
 
742 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.92 
 
 
547 aa  115  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.93 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.6 
 
 
1332 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 
752 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  32.27 
 
 
384 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  31.32 
 
 
313 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  34.26 
 
 
1441 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.58 
 
 
1694 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  35.59 
 
 
271 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  33.14 
 
 
320 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  37.58 
 
 
427 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  27.46 
 
 
263 aa  102  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.52 
 
 
819 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  33.2 
 
 
346 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  27.35 
 
 
277 aa  95.1  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  35.47 
 
 
306 aa  93.2  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 
608 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  36.09 
 
 
319 aa  92  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  35.56 
 
 
256 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  27.44 
 
 
405 aa  92  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 
907 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  30.3 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  28.14 
 
 
475 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.16 
 
 
722 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  30.28 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  30.29 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  32.3 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  29.63 
 
 
467 aa  75.9  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  30.29 
 
 
539 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  29.92 
 
 
470 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  29.64 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  30.29 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  28.75 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  27.76 
 
 
1707 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  29.26 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  28.33 
 
 
469 aa  68.9  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
686 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  30.17 
 
 
318 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  27.59 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.93 
 
 
1007 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  26.87 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  32.76 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  27.59 
 
 
842 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
1184 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.97 
 
 
915 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.94 
 
 
639 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>