More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0810 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 224 aa  87.8  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 333 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.01 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 307 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  28.32 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  27.75 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  32.67 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  22 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  27.83 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  28.85 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  24.2 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  24.47 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 295 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>