236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1328 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 393 aa  762    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  74.04 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  51.59 
 
 		 418 aa  363  3e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  51.17 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  50.51 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  50.53 
 
 		 428 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  51.31 
 
 		 414 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  51.55 
 
 		 392 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  50 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  48.8 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  48.17 
 
 		 393 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  44.04 
 
 		 414 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  47.79 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  51.67 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  48.59 
 
 		 421 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  43.95 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  50.13 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 420 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  49.87 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  49.1 
 
 		 425 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  46.88 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.26 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  47.92 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  48.94 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  46.26 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  46.92 
 
 		 373 aa  275  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.33 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  41.93 
 
 		 539 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  41.36 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  45.07 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  45.58 
 
 		 276 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  46.6 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  31.25 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  44.44 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  44.44 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  44.44 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  31.49 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.44 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  43.1 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  28.4 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  38.24 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  45.59 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  36.73 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  36.78 
 
 		 493 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  29.78 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 547 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  29.3 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  43.42 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  50.88 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 552 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  44.87 
 
 		 681 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  29.25 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  39.29 
 
 		 540 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  27.69 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  33.54 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  42.86 
 
 		 511 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  41.56 
 
 		 478 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  43.04 
 
 		 529 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  35.46 
 
 		 429 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  39.34 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  55.56 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.08 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  41.18 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  42.47 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 526 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  19.25 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  40.28 
 
 		 611 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  32 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  24.31 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  34.52 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  37.35 
 
 		 485 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  24.31 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  47.62 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  24.31 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  24.31 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  54.1 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  43.55 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.78 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  42.47 
 
 		 514 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  32.86 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 514 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  32.93 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  38.67 
 
 		 538 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>