More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3806 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  69.69 
 
 		 451 aa  669    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  73 
 
 		 452 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  100 
 
 		 451 aa  922    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  78.64 
 
 		 452 aa  733    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  77.63 
 
 		 451 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  51.74 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  47.56 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  41.98 
 
 		 420 aa  289  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  35.17 
 
 		 463 aa  249  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  36.49 
 
 		 422 aa  226  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  33.66 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  33.99 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  35.64 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  33.83 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  32.75 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  30.16 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  29.98 
 
 		 467 aa  153  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.1 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  29.16 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.04 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  29.12 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  28.4 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  27.45 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.96 
 
 		 400 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  33.92 
 
 		 242 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  27.63 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  28.29 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  27.63 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  28.05 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  27.7 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  26.52 
 
 		 399 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 402 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.37 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.5 
 
 		 406 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  25.96 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  25.12 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  25.12 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3954  hypothetical protein  69.62 
 
 		 79 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.21 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.33 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.7 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  27.07 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 451 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.76 
 
 		 456 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  36.65 
 
 		 181 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  30.39 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  24.68 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.91 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.19 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.47 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.04 
 
 		 412 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  26.15 
 
 		 409 aa  91.3  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  41.74 
 
 		 137 aa  90.5  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.34 
 
 		 417 aa  90.5  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  25.8 
 
 		 486 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.53 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.35 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.36 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.55 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  26.13 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  23.53 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.9 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  36.31 
 
 		 159 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  26.04 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  26.62 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  24.43 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  44.23 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  24.64 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  23.8 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.86 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  24.94 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.23 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  22.94 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  25.18 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  28.36 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  26.51 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  26.13 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 449 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.51 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.19 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>