More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1907 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 910 aa  1791    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  53.41 
 
 		 488 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  51.1 
 
 		 479 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.39 
 
 		 1783 aa  293  8e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  54.89 
 
 		 528 aa  289  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  56.7 
 
 		 1732 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.63 
 
 		 1356 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  51.97 
 
 		 2036 aa  281  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  50 
 
 		 859 aa  281  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  52.67 
 
 		 1882 aa  280  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  56.52 
 
 		 1236 aa  280  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  50.16 
 
 		 669 aa  278  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  48.66 
 
 		 1094 aa  277  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  51.68 
 
 		 1300 aa  277  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  49.66 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  51.45 
 
 		 1120 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  61.24 
 
 		 3295 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  49.38 
 
 		 735 aa  275  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.25 
 
 		 1241 aa  275  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  52.9 
 
 		 1361 aa  275  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  49.83 
 
 		 575 aa  274  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  48.87 
 
 		 658 aa  274  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  49.18 
 
 		 675 aa  273  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.94 
 
 		 1862 aa  273  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  55 
 
 		 963 aa  273  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  52.3 
 
 		 1969 aa  272  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  51.19 
 
 		 1682 aa  272  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  51.32 
 
 		 1842 aa  271  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  49.68 
 
 		 2272 aa  269  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  49.16 
 
 		 561 aa  269  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  49.84 
 
 		 752 aa  269  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  47.91 
 
 		 679 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.66 
 
 		 615 aa  266  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  50.49 
 
 		 978 aa  265  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  48.89 
 
 		 1667 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  51.09 
 
 		 460 aa  263  8.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  48.23 
 
 		 685 aa  260  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  49.51 
 
 		 2000 aa  260  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  50.9 
 
 		 2122 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  50.15 
 
 		 530 aa  258  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  52.76 
 
 		 547 aa  251  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  53.33 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  52.34 
 
 		 791 aa  249  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  46.84 
 
 		 551 aa  244  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  42.11 
 
 		 930 aa  238  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1282 aa  237  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  50.87 
 
 		 930 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  46.3 
 
 		 838 aa  230  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  44.74 
 
 		 941 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.42 
 
 		 861 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  68.05 
 
 		 2554 aa  209  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.86 
 
 		 1667 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  39.07 
 
 		 1528 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  41.46 
 
 		 1387 aa  197  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  32.83 
 
 		 2552 aa  193  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.91 
 
 		 958 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  42.16 
 
 		 823 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  43.71 
 
 		 443 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  46.79 
 
 		 938 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  37.63 
 
 		 971 aa  183  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  41.84 
 
 		 845 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.71 
 
 		 869 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  42.66 
 
 		 870 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  56.89 
 
 		 184 aa  178  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  43.44 
 
 		 1531 aa  177  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  39.66 
 
 		 439 aa  177  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  41.37 
 
 		 802 aa  174  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.55 
 
 		 719 aa  174  9e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  43.92 
 
 		 840 aa  173  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  53.22 
 
 		 560 aa  173  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  53.18 
 
 		 644 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  36.83 
 
 		 940 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  43.02 
 
 		 1095 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.95 
 
 		 786 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  36.13 
 
 		 1292 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  37.31 
 
 		 821 aa  165  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  54.29 
 
 		 519 aa  165  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  36.34 
 
 		 1380 aa  162  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  42.35 
 
 		 777 aa  158  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  47.09 
 
 		 816 aa  158  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  40.62 
 
 		 2176 aa  158  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.13 
 
 		 819 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  39.79 
 
 		 996 aa  156  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.8 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  49.71 
 
 		 1931 aa  155  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  37.89 
 
 		 1231 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  37.05 
 
 		 1814 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  37.18 
 
 		 1189 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  50.86 
 
 		 1328 aa  152  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  35.49 
 
 		 865 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  33.62 
 
 		 952 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  34.28 
 
 		 929 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  42.08 
 
 		 848 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  36.31 
 
 		 1011 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  49.43 
 
 		 769 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  43.16 
 
 		 400 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  49.7 
 
 		 819 aa  135  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  44.72 
 
 		 684 aa  129  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  36.33 
 
 		 1620 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  36.29 
 
 		 586 aa  124  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>