More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2594 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  100 
 
 		 657 aa  1335    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  57.11 
 
 		 1182 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  54.07 
 
 		 754 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  53.81 
 
 		 918 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  52.56 
 
 		 704 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  56.9 
 
 		 819 aa  328  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 886 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  50.9 
 
 		 936 aa  294  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  61.76 
 
 		 800 aa  293  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  59.83 
 
 		 1289 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  58.92 
 
 		 1248 aa  280  6e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  59.68 
 
 		 945 aa  279  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  47.75 
 
 		 676 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 1047 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 746 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  47.18 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 682 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  47.84 
 
 		 1210 aa  239  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 892 aa  220  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 834 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 727 aa  194  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 1676 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  46.35 
 
 		 991 aa  191  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  37.5 
 
 		 783 aa  191  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  56.07 
 
 		 1019 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 572 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 932 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 1093 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 1093 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 674 aa  174  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 964 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 551 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 771 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 462 aa  171  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 1253 aa  170  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 488 aa  170  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.43 
 
 		 744 aa  170  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 1654 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 1714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 1051 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 681 aa  164  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 945 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 215 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.26 
 
 		 1239 aa  160  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 788 aa  160  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.33 
 
 		 1663 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.39 
 
 		 1668 aa  156  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 912 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 526 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 732 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 347 aa  153  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 941 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 1560 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 723 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 3706 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 767 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 639 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 815 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 913 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  41.11 
 
 		 982 aa  146  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 613 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 654 aa  144  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 642 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 839 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 729 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 1246 aa  140  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 2693 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 878 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  40.53 
 
 		 919 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 764 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 1177 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 909 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 631 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 1051 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 746 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 382 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 782 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 872 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.66 
 
 		 1698 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 813 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 472 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 406 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  38.14 
 
 		 630 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 535 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 1183 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 771 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3536  putative sensory transduction histidine kinase  43.71 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0560358  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  38.57 
 
 		 650 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 693 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 1205 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 790 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 648 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 739 aa  124  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 1390 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>