More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6466 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  52.04 
 
 		 1051 aa  1019    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  41.07 
 
 		 1032 aa  733    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  42.28 
 
 		 1135 aa  829    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1147 aa  2330    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  38.28 
 
 		 1033 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  58.45 
 
 		 1142 aa  1169    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  41.1 
 
 		 1063 aa  730    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  45.69 
 
 		 1022 aa  806    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  53.94 
 
 		 1153 aa  1155    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  36.44 
 
 		 1138 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  37.05 
 
 		 1036 aa  628  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1165 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 1038 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  36.87 
 
 		 1073 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1043 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 1059 aa  562  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  36.45 
 
 		 1065 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  34.87 
 
 		 1058 aa  542  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  35.21 
 
 		 1063 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1129 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1074 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  36.32 
 
 		 1059 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1051 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  33.95 
 
 		 1105 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.26 
 
 		 1028 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1038 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 1093 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1031 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1067 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1065 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 1166 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1059 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 1234 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1033 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1163 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1043 aa  463  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1169 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1041 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1127 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32.51 
 
 		 1010 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1153 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 1098 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1040 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1078 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1102 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1189 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1081 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1081 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1186 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1088 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.61 
 
 		 1071 aa  420  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1081 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1087 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1073 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 1050 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1008 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  31.24 
 
 		 1083 aa  403  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1107 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1099 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1072 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1101 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 		 1071 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1115 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1071 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1011 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1137 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1064 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1068 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1098 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1047 aa  357  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1138 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1044 aa  347  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1039 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1057 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1027 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.46 
 
 		 1025 aa  319  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1084 aa  311  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1088 aa  300  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1116 aa  297  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1176 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 975 aa  261  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 999 aa  260  9e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1040 aa  258  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1043 aa  257  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1046 aa  254  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1128 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1027 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 1014 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 1037 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1152 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1039 aa  244  9e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1053 aa  243  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 962 aa  243  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1129 aa  242  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1132 aa  242  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1116 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1049 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 989 aa  234  7.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1155 aa  234  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1097 aa  233  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>