215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3533 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 1064 aa  2010    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  37.39 
 
 		 929 aa  247  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  33.78 
 
 		 928 aa  221  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 909 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  36.9 
 
 		 884 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  40.05 
 
 		 925 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 928 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 923 aa  197  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 953 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  37.82 
 
 		 922 aa  188  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.73 
 
 		 923 aa  182  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 946 aa  177  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  40.65 
 
 		 940 aa  177  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 950 aa  177  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  38.46 
 
 		 930 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  38.4 
 
 		 928 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.9 
 
 		 919 aa  171  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  37.19 
 
 		 913 aa  168  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  38.92 
 
 		 923 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 903 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 920 aa  159  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.43 
 
 		 913 aa  156  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 918 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.7 
 
 		 929 aa  154  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  38.81 
 
 		 955 aa  154  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 911 aa  151  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 894 aa  151  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 889 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  38.72 
 
 		 913 aa  147  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 905 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 937 aa  145  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  38.08 
 
 		 937 aa  145  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 904 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.82 
 
 		 937 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  36.78 
 
 		 919 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 916 aa  141  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 927 aa  140  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  33.41 
 
 		 917 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.68 
 
 		 940 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.41 
 
 		 961 aa  134  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  38.6 
 
 		 884 aa  131  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 936 aa  128  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.9 
 
 		 938 aa  127  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 995 aa  121  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 910 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 916 aa  105  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  38.67 
 
 		 240 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 915 aa  98.6  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 879 aa  98.2  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 997 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 960 aa  92.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  30.18 
 
 		 919 aa  88.6  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.6 
 
 		 919 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 900 aa  87.4  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  36.96 
 
 		 927 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.6 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  32.76 
 
 		 900 aa  85.5  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30.86 
 
 		 998 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  34.61 
 
 		 956 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  40.44 
 
 		 892 aa  80.1  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 952 aa  79.7  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  32.07 
 
 		 940 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 921 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  29.89 
 
 		 921 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  29.89 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.08 
 
 		 923 aa  77  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.14 
 
 		 954 aa  75.5  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  30.14 
 
 		 977 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 946 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  27.79 
 
 		 897 aa  73.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 1015 aa  72.4  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.43 
 
 		 927 aa  72  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  36.32 
 
 		 934 aa  71.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 		 1429 aa  71.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  29.83 
 
 		 921 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 959 aa  70.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 983 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  29.63 
 
 		 893 aa  70.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  31.02 
 
 		 1006 aa  69.7  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 1190 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 894 aa  67  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.93 
 
 		 947 aa  66.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.03 
 
 		 993 aa  66.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.7 
 
 		 1160 aa  65.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.62 
 
 		 1150 aa  65.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 947 aa  65.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.54 
 
 		 1080 aa  65.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 1005 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.54 
 
 		 1422 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 1030 aa  64.7  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 877 aa  64.7  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 963 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 948 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 876 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  34.64 
 
 		 992 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  34.16 
 
 		 932 aa  63.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.19 
 
 		 1227 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>