91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5080 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  100 
 
 
286 aa  590  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  79.06 
 
 
285 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  74.3 
 
 
286 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  56.94 
 
 
283 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  46.69 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  41.06 
 
 
283 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  35.49 
 
 
292 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  33.68 
 
 
293 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  31.88 
 
 
296 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  32.85 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.22 
 
 
280 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  37.66 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  34.38 
 
 
269 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  32.68 
 
 
269 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.82 
 
 
267 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.67 
 
 
289 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  28.67 
 
 
289 aa  119  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.75 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  27.9 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  29.68 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  30.8 
 
 
257 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.8 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  30.31 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  26.62 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.05 
 
 
277 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.8 
 
 
276 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  29.83 
 
 
306 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  27.8 
 
 
260 aa  104  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.49 
 
 
302 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.07 
 
 
270 aa  103  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.82 
 
 
281 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.52 
 
 
274 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.52 
 
 
274 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  26.24 
 
 
266 aa  100  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.28 
 
 
231 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30 
 
 
231 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.92 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  22.53 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.73 
 
 
274 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.78 
 
 
315 aa  95.5  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  26.92 
 
 
262 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  27.18 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.76 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.85 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0096  pilx9 protein  27.73 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164234  normal  0.522922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  28.45 
 
 
250 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.39 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  27.62 
 
 
250 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.27 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  29.82 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  25.88 
 
 
259 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  23.18 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  22.26 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  23.7 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.69 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.69 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.55 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  23.97 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.83 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.07 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.55 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.51 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.29 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.63 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.89 
 
 
259 aa  59.7  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.3 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.89 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  28.11 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.89 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  26.15 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.5 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  26.94 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  25.12 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.21 
 
 
355 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.71 
 
 
338 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  26.72 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  27.75 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.75 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  25 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.02 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5413  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.58 
 
 
317 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.92 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.7 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5238  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413163  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5008  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.36 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116389  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.7 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.7 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.44 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.96 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  24.57 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  25 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>