146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0219 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  100 
 
 
270 aa  559  1e-158  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  89.64 
 
 
270 aa  484  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  62.95 
 
 
260 aa  333  2e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  53.1 
 
 
266 aa  267  2e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  32.14 
 
 
269 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.59 
 
 
269 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  34.03 
 
 
269 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.35 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.2 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.02 
 
 
277 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  29.15 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  30 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  30 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.3 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.79 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.7 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.31 
 
 
305 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  26.92 
 
 
283 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.62 
 
 
286 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.22 
 
 
285 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.44 
 
 
285 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.74 
 
 
286 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  28.24 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.38 
 
 
270 aa  95.9  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.51 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  26.74 
 
 
278 aa  95.1  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  25.95 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.97 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.52 
 
 
231 aa  92  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  26.39 
 
 
306 aa  89  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.08 
 
 
309 aa  89  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.44 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  25.18 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.18 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  26.96 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.75 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  26.52 
 
 
240 aa  85.5  9e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  25.87 
 
 
311 aa  85.5  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.65 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  25.95 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.59 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.66 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.66 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.83 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.61 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.23 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  23.84 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  25.22 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  23.62 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.66 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.31 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  25.26 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.44 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.89 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  24 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.44 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  25.6 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.56 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.96 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  24.44 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.33 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  23.56 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.32 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.4 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.56 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.51 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.56 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.11 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.44 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.2 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.68 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.76 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.56 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  24 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.22 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.41 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.36 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.5 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.5 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  21.76 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.56 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0002  VirB9  25.45 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.53 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.11 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.95 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.28 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.16 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.16 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.37 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.17 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.67 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.68 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.33 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.33 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.79 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.9 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  25 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.35 
 
 
337 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.27 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.95 
 
 
342 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>