55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7351 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 
302 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.12 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.18 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.18 
 
 
285 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.09 
 
 
286 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.21 
 
 
285 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  27.52 
 
 
278 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  28.99 
 
 
255 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.21 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.18 
 
 
257 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  25.94 
 
 
278 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.08 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.14 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  29.37 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  25.38 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.38 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  24.57 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  24.43 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  23.74 
 
 
262 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.16 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.82 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.94 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.82 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.82 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  23.97 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  27.07 
 
 
293 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.59 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  23.12 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.45 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  23.97 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  23.57 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  23.32 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.33 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.16 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  22.68 
 
 
250 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  23.61 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  22.68 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  22.95 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.64 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.57 
 
 
277 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.73 
 
 
231 aa  62.4  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  20.92 
 
 
311 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.6 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.16 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  23.01 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.55 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.88 
 
 
270 aa  56.6  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.79 
 
 
231 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  22.45 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.81 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  22.1 
 
 
264 aa  52  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.97 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  21.83 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.18 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>