100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0005 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  100 
 
 
264 aa  534  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  46.15 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  45.93 
 
 
273 aa  228  9e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  33.47 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.23 
 
 
270 aa  99  7e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  28.24 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  27.57 
 
 
260 aa  87  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.33 
 
 
274 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  26.89 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.55 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  27.34 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.19 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.19 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  23.53 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  24.34 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.44 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.61 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.71 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  25.75 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  24.63 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.53 
 
 
285 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.24 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.35 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.63 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.97 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  26.71 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.05 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  24.28 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  20.93 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.45 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  25.18 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.29 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  24.19 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.33 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.31 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.68 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  23.6 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.51 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.64 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.35 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.23 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  23.18 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.18 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  24.12 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.37 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  20.38 
 
 
293 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.5 
 
 
301 aa  62.4  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.97 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.03 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.62 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  21.72 
 
 
296 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  23.45 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  21.27 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.57 
 
 
315 aa  58.9  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.3 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.3 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0096  pilx9 protein  22.96 
 
 
309 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164234  normal  0.522922 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  24.15 
 
 
311 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  21.9 
 
 
327 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.72 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  25.59 
 
 
296 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.36 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.1 
 
 
302 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.72 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.93 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  20.55 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.37 
 
 
333 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  25.25 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.74 
 
 
345 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.15 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  20.98 
 
 
329 aa  48.9  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  20.98 
 
 
330 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  20.29 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  24.74 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.3 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.71 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  22.75 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  21.95 
 
 
329 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.08 
 
 
255 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.6 
 
 
330 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.68 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.44 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.93 
 
 
333 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  20.98 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.44 
 
 
334 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  21.95 
 
 
331 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.46 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  21.46 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  20.49 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.49 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  20.77 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.4 
 
 
334 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  29.87 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  20.49 
 
 
333 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.46 
 
 
326 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  24.49 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  24.32 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  18.75 
 
 
293 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  20.98 
 
 
333 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.14 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>