71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0043 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  78.83 
 
 
274 aa  435  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  45.93 
 
 
264 aa  228  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  34.87 
 
 
240 aa  140  3e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  29.15 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.37 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  30.45 
 
 
260 aa  112  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.55 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.88 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  26.89 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.65 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.91 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.18 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.46 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.38 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.83 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.64 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.64 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.7 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  24.07 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  23.85 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  26.58 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  26.85 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  24.9 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.27 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.57 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.58 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.4 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.99 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.6 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  27.19 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.39 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.67 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.76 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  26.46 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.6 
 
 
231 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  21.48 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  26.05 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  26.05 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.59 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.88 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.94 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  22.1 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.29 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.08 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.99 
 
 
305 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  22.98 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  22.55 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  22.55 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  20.86 
 
 
297 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.66 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.88 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  24.02 
 
 
295 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.48 
 
 
293 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.48 
 
 
293 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.4 
 
 
268 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.23 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  21.48 
 
 
301 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.2 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  22.37 
 
 
311 aa  48.9  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.99 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.9 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  20.42 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  27.13 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.83 
 
 
302 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  19.06 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  19.76 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  22.17 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5238  hypothetical protein  50 
 
 
437 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413163  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  22.43 
 
 
296 aa  42  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>