128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1507 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  100 
 
 
327 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  70.37 
 
 
315 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  61.74 
 
 
318 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.67 
 
 
326 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.67 
 
 
326 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  63.09 
 
 
328 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  61.69 
 
 
326 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.63 
 
 
342 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  62.88 
 
 
298 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  60.33 
 
 
342 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.81 
 
 
334 aa  355  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.68 
 
 
334 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.73 
 
 
347 aa  345  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  59.52 
 
 
338 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.55 
 
 
346 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  56.49 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  53.52 
 
 
328 aa  335  5.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.86 
 
 
341 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  53.17 
 
 
339 aa  330  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.77 
 
 
357 aa  329  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  53.37 
 
 
350 aa  329  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.69 
 
 
341 aa  329  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  53.31 
 
 
350 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  53.82 
 
 
347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.09 
 
 
341 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.84 
 
 
355 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  53.61 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.63 
 
 
330 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  50 
 
 
333 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  51.08 
 
 
338 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  49.21 
 
 
326 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  47.29 
 
 
333 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.14 
 
 
343 aa  285  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  47.69 
 
 
337 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.46 
 
 
334 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  46.99 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  49.52 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  48.88 
 
 
329 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  46.99 
 
 
331 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  47.35 
 
 
334 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  47.11 
 
 
330 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.56 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  47.63 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  45.72 
 
 
330 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.71 
 
 
333 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.18 
 
 
337 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  45.29 
 
 
334 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  53.97 
 
 
283 aa  269  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.44 
 
 
330 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  46.08 
 
 
339 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  53.17 
 
 
327 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  50.64 
 
 
278 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  40.75 
 
 
293 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  39.08 
 
 
314 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  40.62 
 
 
312 aa  209  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  44.32 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  39.04 
 
 
345 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  42.74 
 
 
266 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  37.87 
 
 
348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  36.57 
 
 
338 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  36.36 
 
 
296 aa  126  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  37.55 
 
 
295 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  37.1 
 
 
299 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  38.43 
 
 
296 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  38.14 
 
 
284 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  37.1 
 
 
299 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  35.71 
 
 
273 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  36.65 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  35.24 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  35.53 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  34.78 
 
 
270 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  35.5 
 
 
292 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.84 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.74 
 
 
231 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.51 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.21 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.12 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.69 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.09 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.91 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.75 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.86 
 
 
284 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.34 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  25.73 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.21 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  29.7 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.03 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  26.13 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.75 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.23 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  27.57 
 
 
278 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.89 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.48 
 
 
276 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  23.43 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.01 
 
 
270 aa  62.8  0.000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  27.64 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  26.64 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  27.86 
 
 
250 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.75 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.99 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>