127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6499 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 
276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  76 
 
 
278 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  74.82 
 
 
278 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  76.05 
 
 
281 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  72.83 
 
 
278 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  63.41 
 
 
274 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  63.41 
 
 
274 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  62.68 
 
 
274 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  37.42 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  37.81 
 
 
289 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  37.81 
 
 
289 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  40.23 
 
 
292 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  36.09 
 
 
315 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  35.88 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  32.63 
 
 
255 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  34.42 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.71 
 
 
305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.82 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.34 
 
 
280 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.09 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.62 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  33.22 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  30.36 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  26.69 
 
 
295 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.96 
 
 
286 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.43 
 
 
286 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.96 
 
 
231 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  28.83 
 
 
262 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  30.07 
 
 
296 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.92 
 
 
269 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  31.08 
 
 
269 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.36 
 
 
269 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.55 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.96 
 
 
231 aa  98.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  26.37 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  29.79 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  26.32 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.99 
 
 
231 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.97 
 
 
265 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  29.36 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  28.64 
 
 
250 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.68 
 
 
297 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  28.57 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.02 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.18 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.13 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0096  pilx9 protein  28.62 
 
 
309 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164234  normal  0.522922 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  24.05 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  27.3 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.83 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  25.56 
 
 
264 aa  82  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.64 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.24 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.16 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  27.15 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.6 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  25.68 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.6 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.88 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  24.27 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.38 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.54 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.99 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.57 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.51 
 
 
268 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  26.48 
 
 
327 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.01 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.06 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.07 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.32 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.27 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.83 
 
 
291 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.7 
 
 
347 aa  58.9  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.89 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.49 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.65 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.23 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.17 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.67 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.07 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  27.31 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.17 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.54 
 
 
339 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.23 
 
 
339 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.23 
 
 
355 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.88 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.88 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.71 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.15 
 
 
330 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.32 
 
 
355 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.21 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.6 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.12 
 
 
331 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.64 
 
 
334 aa  48.9  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.67 
 
 
329 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.19 
 
 
330 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.79 
 
 
357 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.46 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.15 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>