41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5238 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5238  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  881    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5454  hypothetical protein  30.89 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131248  decreased coverage  0.00950425 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4757  hypothetical protein  30.51 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4251  hypothetical protein  26.5 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  35.23 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  31 
 
 		 599 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  35.09 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  34.86 
 
 		 266 aa  54.7  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  35.09 
 
 		 250 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  34.72 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.33 
 
 		 255 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  35.63 
 
 		 404 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  34.72 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1978  PilL domain-containing protein  37.36 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00413738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0657  PilL domain-containing protein  37.36 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2174  PilL domain-containing protein  37.36 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000606761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1611  PilL domain-containing protein  37.36 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2258  PilL domain-containing protein  38 
 
 		 199 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.21 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  36.84 
 
 		 270 aa  47.8  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  31.17 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  30.67 
 
 		 255 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  36.84 
 
 		 270 aa  47  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  39.77 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  35.9 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  34.21 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  29.79 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.37 
 
 		 285 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5006  lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 		 136 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840995  normal  0.821315 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  43.48 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  33.33 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  31.71 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  29.67 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  32.99 
 
 		 278 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.6 
 
 		 315 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.03 
 
 		 276 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  30.23 
 
 		 257 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  31.58 
 
 		 292 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>