133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3696 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  50.92 
 
 
280 aa  275  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.8 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.86 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.95 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.56 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.1 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.1 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  27.73 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.73 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.63 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.24 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.92 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.1 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.11 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  27.57 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  28.27 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.81 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.28 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  27.44 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  24.68 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.37 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  26.94 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  26.21 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  29.36 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.81 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.86 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  26.78 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.64 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.67 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.18 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.69 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  26.07 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.35 
 
 
357 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
305 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.58 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.61 
 
 
334 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.36 
 
 
338 aa  63.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.84 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.16 
 
 
343 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  23.61 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  24.23 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  25.99 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.21 
 
 
341 aa  62.4  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  21.88 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.02 
 
 
347 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.65 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  39.05 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.21 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  23.85 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.07 
 
 
355 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.18 
 
 
337 aa  59.7  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.58 
 
 
333 aa  59.3  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.59 
 
 
276 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.84 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.38 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  26.59 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.69 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.28 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  26.69 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.74 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.27 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  23.9 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  24.82 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.96 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  24.32 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  27 
 
 
292 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  25 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.79 
 
 
326 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.79 
 
 
326 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.2 
 
 
350 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.15 
 
 
341 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.39 
 
 
350 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.53 
 
 
333 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  25.85 
 
 
334 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  24.8 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.32 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.27 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.07 
 
 
348 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  26 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.2 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.85 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.37 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5008  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.89 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116389  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.81 
 
 
355 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  23.04 
 
 
273 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  26.36 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  25.25 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.76 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.69 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.45 
 
 
328 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  25.25 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  25.25 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  25 
 
 
333 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  24.09 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.19 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>