119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0741 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  100 
 
 
341 aa  691    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  97.95 
 
 
341 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  87.39 
 
 
341 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  77.06 
 
 
350 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  76.37 
 
 
347 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  74.64 
 
 
350 aa  534  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  78.3 
 
 
355 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  76.18 
 
 
339 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  71.81 
 
 
357 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  67.26 
 
 
346 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  67.28 
 
 
334 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  71.38 
 
 
328 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  66.56 
 
 
328 aa  435  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  65.27 
 
 
333 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  67.17 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.76 
 
 
337 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.27 
 
 
330 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.58 
 
 
331 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.21 
 
 
339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  64.21 
 
 
343 aa  359  4e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.16 
 
 
333 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  59.62 
 
 
329 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.53 
 
 
330 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  56.35 
 
 
334 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.14 
 
 
334 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.84 
 
 
326 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.1 
 
 
329 aa  348  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.53 
 
 
318 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.01 
 
 
333 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.63 
 
 
329 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  55.45 
 
 
334 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.43 
 
 
330 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.56 
 
 
333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.95 
 
 
337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.53 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  59.72 
 
 
298 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.34 
 
 
326 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.34 
 
 
326 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  54.86 
 
 
327 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.55 
 
 
328 aa  331  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.73 
 
 
342 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.79 
 
 
326 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.41 
 
 
330 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  60.61 
 
 
283 aa  322  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  56.83 
 
 
315 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  51.75 
 
 
342 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.94 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  51.05 
 
 
334 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  54.78 
 
 
298 aa  298  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  49.39 
 
 
347 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.8 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.04 
 
 
278 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.25 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  44.73 
 
 
293 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  42.68 
 
 
314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  50.22 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  36.63 
 
 
345 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.97 
 
 
355 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.95 
 
 
348 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  37.97 
 
 
299 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  37.97 
 
 
299 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  37.59 
 
 
299 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  41.18 
 
 
296 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  40.71 
 
 
295 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  38.49 
 
 
296 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  40.69 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  38.24 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  38.2 
 
 
338 aa  143  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  39.22 
 
 
270 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  37.75 
 
 
273 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  36.59 
 
 
279 aa  132  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.76 
 
 
292 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.44 
 
 
277 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.34 
 
 
260 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.7 
 
 
231 aa  89.4  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.67 
 
 
267 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.26 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.34 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  28.1 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.38 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.74 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.1 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.83 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.37 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.72 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0859  hypothetical protein  73.21 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.31 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.46 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.44 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.44 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.22 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  24.79 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  24.49 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.65 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  25.33 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.32 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.33 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.79 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.74 
 
 
280 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>