134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3859 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 
328 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  80 
 
 
318 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  74.85 
 
 
326 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  74.85 
 
 
326 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  79.94 
 
 
326 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  74.77 
 
 
342 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  81.31 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  78.6 
 
 
298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  67.28 
 
 
342 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  72.7 
 
 
334 aa  427  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  69.33 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  64.95 
 
 
315 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  60.87 
 
 
327 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.09 
 
 
341 aa  341  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  53.45 
 
 
341 aa  338  7e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.49 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.54 
 
 
347 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.29 
 
 
357 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.87 
 
 
350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.8 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  53.29 
 
 
334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  56.27 
 
 
328 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  53.54 
 
 
346 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.73 
 
 
350 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  51.78 
 
 
355 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  53.11 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  51.2 
 
 
333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  51.56 
 
 
338 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  49.38 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.34 
 
 
343 aa  276  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  48 
 
 
330 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  46.69 
 
 
337 aa  271  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  49.07 
 
 
334 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  51.35 
 
 
283 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  48.28 
 
 
334 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  46.15 
 
 
329 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.62 
 
 
331 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  46.45 
 
 
334 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  47.29 
 
 
330 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.41 
 
 
329 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.08 
 
 
333 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  47.76 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.43 
 
 
333 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  45.87 
 
 
333 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  47.2 
 
 
339 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  48.23 
 
 
329 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  46.11 
 
 
330 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  46.39 
 
 
330 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  47.44 
 
 
330 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.51 
 
 
327 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.97 
 
 
298 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  51.05 
 
 
278 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.93 
 
 
293 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  38.73 
 
 
312 aa  206  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  42 
 
 
314 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  42.15 
 
 
355 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  44.78 
 
 
266 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  40.32 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.88 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  36.36 
 
 
296 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  36.71 
 
 
270 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  35.1 
 
 
273 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  35.89 
 
 
284 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  34.45 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.64 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  35.47 
 
 
299 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  35.47 
 
 
299 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  35 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  35.04 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  32.31 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.51 
 
 
292 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  34.04 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.04 
 
 
282 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.27 
 
 
260 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.36 
 
 
231 aa  87.4  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.96 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  29.33 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.19 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.18 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.9 
 
 
269 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  25.83 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  29.33 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  28.71 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  28.57 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.22 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.26 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.84 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.09 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  23.53 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  28.64 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.05 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.64 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  28.02 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  30.2 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.97 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.57 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.99 
 
 
274 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.47 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.47 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>