128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0959 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  100 
 
 
333 aa  673    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  73.01 
 
 
357 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  67.37 
 
 
328 aa  428  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  66.07 
 
 
347 aa  428  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  70.06 
 
 
355 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  66.36 
 
 
339 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  65.17 
 
 
341 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  65.56 
 
 
346 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  64.2 
 
 
334 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  65.27 
 
 
341 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  65.66 
 
 
341 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  63.96 
 
 
350 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  66.27 
 
 
328 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  63.22 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  64.55 
 
 
338 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.64 
 
 
337 aa  358  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.72 
 
 
330 aa  358  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.27 
 
 
334 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.61 
 
 
333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.84 
 
 
333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  57.96 
 
 
334 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.64 
 
 
334 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  59.81 
 
 
329 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.57 
 
 
333 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.28 
 
 
326 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  59.52 
 
 
329 aa  346  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.76 
 
 
331 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.97 
 
 
330 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  60.69 
 
 
343 aa  344  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.57 
 
 
337 aa  343  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.91 
 
 
329 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  61.15 
 
 
298 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.24 
 
 
330 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.27 
 
 
330 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.27 
 
 
330 aa  331  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.08 
 
 
339 aa  329  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  53.61 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  50.6 
 
 
326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  50.6 
 
 
326 aa  305  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.69 
 
 
283 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.68 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  50.31 
 
 
342 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  51.2 
 
 
318 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  52.57 
 
 
315 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.65 
 
 
334 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  49.85 
 
 
326 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  49.7 
 
 
342 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.53 
 
 
347 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.65 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.8 
 
 
338 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  49.21 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.25 
 
 
278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.25 
 
 
312 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  45.59 
 
 
355 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  39.57 
 
 
314 aa  222  9e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  42.48 
 
 
293 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  42.16 
 
 
345 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.91 
 
 
266 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.69 
 
 
348 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  38.68 
 
 
284 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  37.9 
 
 
338 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  37.74 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  36.79 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  38.21 
 
 
270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  36.28 
 
 
279 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  36.05 
 
 
295 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  31.65 
 
 
299 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  31.65 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  31.65 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  34.43 
 
 
273 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  35.19 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.76 
 
 
282 aa  102  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.59 
 
 
231 aa  96.3  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.51 
 
 
268 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.98 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.38 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0859  hypothetical protein  74.07 
 
 
161 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.04 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.78 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.04 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.71 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  26.29 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.62 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  25 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.84 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.46 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.74 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.35 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.15 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.76 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  25 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.36 
 
 
293 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.12 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.36 
 
 
293 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.78 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.58 
 
 
272 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.1 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  25.6 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  22.73 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>