60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0859 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0859  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  90.32 
 
 		 339 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  83.64 
 
 		 357 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  74.07 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  73.21 
 
 		 341 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  73.21 
 
 		 341 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  69.64 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  69.64 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  69.64 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  66.67 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  66.67 
 
 		 346 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  64.81 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  66.07 
 
 		 350 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  63.64 
 
 		 350 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  64 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  65.38 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  62.96 
 
 		 293 aa  61.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.55 
 
 		 326 aa  60.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.55 
 
 		 326 aa  60.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.36 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  64.58 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  62.26 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.55 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  62.26 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  61.11 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  63.46 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  59.65 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.89 
 
 		 329 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  50.91 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  60.38 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  60.38 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  60.38 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  60.38 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  60.38 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.93 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  60.38 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.73 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  60.38 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  60.38 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  60.38 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.49 
 
 		 326 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.49 
 
 		 329 aa  54.3  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.49 
 
 		 330 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.49 
 
 		 333 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.14 
 
 		 343 aa  53.9  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  51.92 
 
 		 342 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.35 
 
 		 312 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  50 
 
 		 338 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  54.72 
 
 		 327 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.15 
 
 		 342 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.08 
 
 		 347 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.08 
 
 		 334 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  58 
 
 		 355 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  50 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.15 
 
 		 345 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.38 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.75 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  55 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  50 
 
 		 278 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.54 
 
 		 266 aa  41.6  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>