121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1187 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  80.52 
 
 
282 aa  382  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.6 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.6 
 
 
330 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.08 
 
 
330 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.88 
 
 
339 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.17 
 
 
337 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  32.55 
 
 
334 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.6 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.08 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.6 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.6 
 
 
330 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  32.08 
 
 
329 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.13 
 
 
330 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.6 
 
 
334 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.6 
 
 
329 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.13 
 
 
333 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.6 
 
 
331 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.13 
 
 
333 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.88 
 
 
278 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.19 
 
 
330 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.18 
 
 
355 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.45 
 
 
327 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.3 
 
 
293 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.13 
 
 
326 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  27.85 
 
 
315 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.3 
 
 
312 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.37 
 
 
334 aa  99.8  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.76 
 
 
345 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.63 
 
 
341 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  29.74 
 
 
327 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.05 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  30 
 
 
357 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.78 
 
 
347 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.59 
 
 
333 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.09 
 
 
346 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.86 
 
 
334 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.81 
 
 
328 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.73 
 
 
348 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.91 
 
 
343 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.19 
 
 
337 aa  92  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.05 
 
 
347 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.99 
 
 
314 aa  91.7  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.43 
 
 
342 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.58 
 
 
355 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.32 
 
 
338 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.75 
 
 
342 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.32 
 
 
326 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.32 
 
 
326 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.7 
 
 
341 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.7 
 
 
341 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.41 
 
 
283 aa  89  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.17 
 
 
350 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.91 
 
 
318 aa  88.2  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  26.46 
 
 
298 aa  88.2  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.93 
 
 
338 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.09 
 
 
339 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.42 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.36 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.36 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.7 
 
 
350 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  28.29 
 
 
299 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.88 
 
 
326 aa  85.5  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  28.8 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  28.8 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  26.27 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  28.77 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.07 
 
 
338 aa  82  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  26.96 
 
 
269 aa  82  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  29.44 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.81 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.4 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.42 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  27.51 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  27.67 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.25 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  27.27 
 
 
279 aa  71.6  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  27.18 
 
 
284 aa  71.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.58 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  26.6 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.34 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.57 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  26.94 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.27 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.43 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  26.82 
 
 
259 aa  62  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  24.75 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.88 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  28.23 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.93 
 
 
293 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.93 
 
 
293 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  24.44 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.03 
 
 
291 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  22.64 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.7 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  23.27 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  21.8 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  22.75 
 
 
278 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.08 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.17 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>