148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5456 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  42.18 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  41.34 
 
 
255 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  36.57 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.03 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.23 
 
 
293 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.23 
 
 
293 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.76 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.4 
 
 
293 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.46 
 
 
346 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  30 
 
 
329 aa  99  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.83 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.98 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.34 
 
 
355 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.86 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.76 
 
 
345 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.51 
 
 
333 aa  95.5  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  34.44 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.9 
 
 
334 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5008  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.48 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116389  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.63 
 
 
314 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.64 
 
 
339 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.76 
 
 
339 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.08 
 
 
333 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  30.47 
 
 
334 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.63 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.43 
 
 
337 aa  92.8  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.45 
 
 
330 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.29 
 
 
330 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.65 
 
 
334 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.67 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5413  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.04 
 
 
317 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.44 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.12 
 
 
350 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.85 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.22 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.82 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.46 
 
 
333 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  30.91 
 
 
329 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.52 
 
 
329 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  28.95 
 
 
270 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.8 
 
 
331 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  28.26 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  28.38 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.02 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.58 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.68 
 
 
326 aa  86.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.87 
 
 
347 aa  86.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.63 
 
 
350 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.57 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.9 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  28.51 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.56 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.11 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.82 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.87 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  26.19 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.78 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  27.95 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.97 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.36 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.36 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  28 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.74 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  28.43 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.29 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.57 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.74 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  26.72 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.53 
 
 
305 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  27.84 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  27.84 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.44 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  28.44 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.74 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  27.47 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.25 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  30.04 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  27.23 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.73 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.38 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.26 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  25.1 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.26 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  28.83 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.63 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.26 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.95 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.76 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  26.64 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.62 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.29 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  26.29 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.02 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.7 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.21 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.69 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.3 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.3 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>