66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5413 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5413  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 		 317 aa  653    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5008  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  98.74 
 
 		 317 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.96 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.95 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.04 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.15 
 
 		 284 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.92 
 
 		 255 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.83 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.83 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.23 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  29.68 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.03 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  27.49 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  26.56 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.09 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  22.65 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.74 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  28.24 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.32 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.67 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.89 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  22.36 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  23.9 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.3 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.01 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.12 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.38 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.32 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  26 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  22.22 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.36 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  23.19 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  23.31 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.5 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  23.89 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  23.67 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.37 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  23.14 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  25.62 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.27 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.55 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.88 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  21.86 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.88 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.86 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  22.31 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.83 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.22 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  23.6 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.17 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.17 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  21.43 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  23.67 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  23.02 
 
 		 273 aa  43.5  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.18 
 
 		 231 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.03 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.13 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.13 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.27 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.32 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.38 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.93 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  24.39 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.01 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.31 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.91 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>