112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0742 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  32.58 
 
 
273 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.47 
 
 
274 aa  131  9e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  33.05 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  32.2 
 
 
269 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.6 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.4 
 
 
269 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  30.12 
 
 
283 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  30.08 
 
 
269 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.8 
 
 
269 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.77 
 
 
277 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  30.12 
 
 
266 aa  100  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.22 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.76 
 
 
286 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.45 
 
 
285 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  26.52 
 
 
270 aa  85.5  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.98 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.98 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.14 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  26.67 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.52 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.92 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.26 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.47 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  25.09 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.58 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.15 
 
 
276 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.21 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  28.49 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  26.91 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  25 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  23.32 
 
 
278 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.36 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  26.34 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.61 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  23.53 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  22.42 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.77 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  24.1 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  24.33 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  23.27 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  23.97 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.47 
 
 
305 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.35 
 
 
280 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.01 
 
 
281 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  27.78 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.1 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.25 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.26 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.9 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  28.8 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.37 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.37 
 
 
293 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.36 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  27.81 
 
 
284 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.61 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  28.19 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.32 
 
 
292 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  23.84 
 
 
273 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.14 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  22.05 
 
 
306 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.68 
 
 
330 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  26.98 
 
 
296 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.64 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.19 
 
 
282 aa  51.2  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  20.27 
 
 
329 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.41 
 
 
334 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.41 
 
 
333 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  24.35 
 
 
329 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  22.89 
 
 
296 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.14 
 
 
334 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.89 
 
 
330 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  20.64 
 
 
297 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.14 
 
 
298 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  26.75 
 
 
299 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  26.75 
 
 
299 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
330 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.48 
 
 
330 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.01 
 
 
330 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  26.75 
 
 
299 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.14 
 
 
329 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.59 
 
 
231 aa  48.9  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.48 
 
 
331 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.01 
 
 
333 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.14 
 
 
337 aa  48.5  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  23.86 
 
 
334 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  21.52 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.48 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  21.52 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.48 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.52 
 
 
347 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  21.17 
 
 
293 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.26 
 
 
312 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.92 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22 
 
 
284 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.91 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  23.08 
 
 
315 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.27 
 
 
357 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5413  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.27 
 
 
317 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>