148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1104 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  534  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  65.57 
 
 
270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  62.95 
 
 
270 aa  333  2e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  49.61 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.97 
 
 
269 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.23 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  32.56 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  30.86 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.92 
 
 
269 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.28 
 
 
277 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.98 
 
 
280 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.63 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  33.19 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  31.93 
 
 
250 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  30.45 
 
 
273 aa  112  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  28.17 
 
 
289 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.17 
 
 
289 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  28.74 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.92 
 
 
292 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.24 
 
 
285 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.63 
 
 
286 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.74 
 
 
286 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.22 
 
 
274 aa  99  7e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.79 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  28.75 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.27 
 
 
257 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.23 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  27.57 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  27.05 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.69 
 
 
281 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.69 
 
 
231 aa  92  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  26.41 
 
 
278 aa  88.6  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.14 
 
 
293 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.14 
 
 
293 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.39 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  27.57 
 
 
264 aa  87  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  27.8 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.07 
 
 
290 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  26.85 
 
 
278 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.68 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.89 
 
 
338 aa  85.9  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.79 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.19 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.34 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.69 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  28 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.99 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.19 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.83 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.31 
 
 
314 aa  82  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  26.38 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  29.03 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  24.32 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.83 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  27.66 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  27.27 
 
 
311 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.18 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.18 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.83 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.83 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.05 
 
 
342 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.47 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.67 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  23.95 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.91 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.23 
 
 
342 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.83 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.55 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.82 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.83 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  25 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.51 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0002  VirB9  26.75 
 
 
356 aa  72  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  28.27 
 
 
296 aa  72  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.51 
 
 
355 aa  72  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.83 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.9 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  21.93 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.62 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  28.57 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  25.73 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.31 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  26.22 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.77 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.44 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.33 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.56 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.58 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  25.1 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.73 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.32 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.28 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.89 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.31 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  27.51 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.58 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.49 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  24.6 
 
 
350 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.56 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>