129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6570 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  71.43 
 
 
291 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.49 
 
 
303 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.71 
 
 
293 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.71 
 
 
293 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.05 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.33 
 
 
270 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.2 
 
 
290 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.59 
 
 
284 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.4 
 
 
268 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.07 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  33.63 
 
 
279 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.58 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.56 
 
 
350 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  31.72 
 
 
296 aa  89  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.61 
 
 
329 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  29.18 
 
 
273 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  29.6 
 
 
270 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.11 
 
 
357 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.48 
 
 
347 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.33 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.49 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.77 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.27 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.89 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  30.16 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.26 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.51 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.06 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.86 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.06 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  31.53 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  30 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.51 
 
 
339 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  30.64 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  32.04 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.64 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.37 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.58 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.34 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.8 
 
 
337 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.44 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.62 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  30.64 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.83 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.64 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.09 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.95 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.64 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  29.25 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.22 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  29.11 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.04 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  28.17 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.36 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.96 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.73 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.26 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.64 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.94 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  30.64 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.39 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.49 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.94 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.61 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.88 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.9 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.05 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.17 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.28 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.64 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.45 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.11 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.38 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.87 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.65 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.05 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.05 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  26.03 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.64 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  25.22 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.33 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  28.04 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  28.04 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  28.04 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.58 
 
 
348 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.06 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.33 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  27.68 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  30.17 
 
 
298 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.33 
 
 
231 aa  59.7  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.13 
 
 
292 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.28 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  26.97 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.44 
 
 
347 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  30 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  26.81 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  29.14 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>