145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1143 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  100 
 
 
257 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.17 
 
 
305 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  37.35 
 
 
267 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  32.03 
 
 
289 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  32.03 
 
 
289 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  38.52 
 
 
281 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  38.02 
 
 
278 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  34.5 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  36.44 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  38.71 
 
 
278 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  36.03 
 
 
274 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  36.03 
 
 
274 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  37.3 
 
 
276 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  37.3 
 
 
278 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.88 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  33.33 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  32.83 
 
 
255 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  32.85 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.04 
 
 
269 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  33.57 
 
 
285 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  31.12 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  35.94 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  34.1 
 
 
269 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.2 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  29.68 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.69 
 
 
315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  34.56 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.77 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  30.29 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  28.79 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.38 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.9 
 
 
231 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  28.98 
 
 
292 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.92 
 
 
270 aa  104  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.06 
 
 
286 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.61 
 
 
265 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  28.35 
 
 
259 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  30 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  27.5 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  27.5 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  24.32 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.36 
 
 
277 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.18 
 
 
302 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  27.44 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.29 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.7 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  24.06 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.74 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.75 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.69 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.17 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  25.53 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3696  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.81 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  26.6 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.71 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.2 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  26.6 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.11 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.22 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.22 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  29.86 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.47 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0096  pilx9 protein  23.68 
 
 
309 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164234  normal  0.522922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  27.23 
 
 
327 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.35 
 
 
339 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.9 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.5 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  26.11 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  30.77 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.21 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.32 
 
 
339 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.27 
 
 
296 aa  62.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.21 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.5 
 
 
343 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.64 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.71 
 
 
330 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  27.05 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.03 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.77 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.86 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.99 
 
 
355 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.84 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.7 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  25.58 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.73 
 
 
330 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.03 
 
 
328 aa  59.7  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.34 
 
 
341 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  28.43 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.72 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  29.27 
 
 
338 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.9 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  28.29 
 
 
350 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  25.37 
 
 
341 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.72 
 
 
331 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.83 
 
 
341 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  27.27 
 
 
329 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.23 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  27.32 
 
 
350 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.23 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>