127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2034 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  100 
 
 
327 aa  656    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  68.99 
 
 
339 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  61.08 
 
 
334 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.67 
 
 
347 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  61.71 
 
 
328 aa  361  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.33 
 
 
346 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  60.65 
 
 
355 aa  359  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.04 
 
 
339 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  59.31 
 
 
357 aa  356  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.59 
 
 
328 aa  355  6.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.62 
 
 
341 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.23 
 
 
341 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.63 
 
 
350 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.18 
 
 
341 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.63 
 
 
350 aa  349  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.21 
 
 
330 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  55.38 
 
 
334 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  55.59 
 
 
334 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.56 
 
 
333 aa  337  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  55.86 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.73 
 
 
333 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.77 
 
 
337 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.21 
 
 
331 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.31 
 
 
333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  56.17 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  55.84 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  54.21 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  54.4 
 
 
326 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.17 
 
 
333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.45 
 
 
330 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.3 
 
 
298 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.41 
 
 
329 aa  319  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.66 
 
 
338 aa  316  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.7 
 
 
330 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.07 
 
 
330 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  50.76 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  55.24 
 
 
343 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  49.4 
 
 
315 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  47.65 
 
 
327 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  48.42 
 
 
318 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  49.33 
 
 
328 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.43 
 
 
326 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.43 
 
 
326 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  50.19 
 
 
283 aa  258  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  45.87 
 
 
342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.73 
 
 
334 aa  251  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  53.28 
 
 
326 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.57 
 
 
347 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  45.4 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  51.39 
 
 
338 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  47.86 
 
 
293 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  48.39 
 
 
298 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.36 
 
 
278 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  50.83 
 
 
314 aa  233  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  42.11 
 
 
312 aa  232  8.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  48.06 
 
 
355 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  44.13 
 
 
345 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  33.63 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  40.16 
 
 
266 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  42.64 
 
 
296 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  42.27 
 
 
284 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  40.89 
 
 
273 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  37.86 
 
 
299 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  37.86 
 
 
299 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  38.36 
 
 
295 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  42.65 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  38.82 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  43.89 
 
 
273 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  37.45 
 
 
299 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.28 
 
 
338 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  42.16 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.31 
 
 
292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.69 
 
 
231 aa  105  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.7 
 
 
282 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.44 
 
 
268 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.34 
 
 
260 aa  95.9  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  29.5 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  29 
 
 
269 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.76 
 
 
290 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  35.56 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.72 
 
 
277 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.07 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.7 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.44 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  26.47 
 
 
260 aa  79  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.16 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.8 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.8 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.08 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.34 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  25.64 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.71 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  29.15 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.79 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.59 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.59 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.45 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  29.38 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  27.92 
 
 
250 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.95 
 
 
231 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>