119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0603 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0603  P-type conjugative transfer protein TrbG  100 
 
 
350 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3992  P-type conjugative transfer protein TrbG  93.14 
 
 
350 aa  673    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0363697  normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2996  P-type conjugative transfer protein TrbG  80.4 
 
 
347 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3094  P-type conjugative transfer protein TrbG  80.68 
 
 
355 aa  564  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3835  P-type conjugative transfer protein TrbG  76.08 
 
 
341 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0741  P-type conjugative transfer protein TrbG  74.64 
 
 
341 aa  534  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2886  P-type conjugative transfer protein TrbG  75.22 
 
 
341 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2092  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  74.16 
 
 
339 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2832  P-type conjugative transfer protein TrbG  70.14 
 
 
357 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.471623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3533  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  69.23 
 
 
346 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3893  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  68.69 
 
 
334 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  70.85 
 
 
328 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7448  putative conjugal transfer protein trbG  72.9 
 
 
328 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  66.47 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0959  P-type conjugative transfer protein TrbG  63.22 
 
 
333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2606  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  60.06 
 
 
337 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  65.05 
 
 
343 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.54 
 
 
330 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2652  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.54 
 
 
331 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.19 
 
 
339 aa  358  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  57.4 
 
 
334 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2691  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.58 
 
 
333 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.47 
 
 
337 aa  353  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2903  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.1 
 
 
326 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.369885  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2012  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.14 
 
 
334 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.62042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.97 
 
 
334 aa  345  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30860  TrbG-like protein  58.97 
 
 
329 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000570551  unclonable  3.4703699999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  58.65 
 
 
329 aa  342  7e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1903  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.63 
 
 
330 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.7 
 
 
333 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1558  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.33 
 
 
333 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00584064  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.63 
 
 
329 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3698  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  57.83 
 
 
330 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.24 
 
 
326 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  52.24 
 
 
326 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  53.19 
 
 
318 aa  332  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  60.07 
 
 
298 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1349  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  56.93 
 
 
330 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000992515  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1507  conjugal transfer protein trbG  53.37 
 
 
327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642267  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  58.01 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  61.39 
 
 
283 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  53.85 
 
 
328 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.44 
 
 
326 aa  311  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.92 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3372  putative conjugal transfer protein trbG  52.56 
 
 
315 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.207123  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  49.24 
 
 
342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  49.85 
 
 
342 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2034  P-type conjugative transfer protein TrbG  57.1 
 
 
327 aa  305  8.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466977  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  52.6 
 
 
347 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.243978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7749  putative conjugal transfer protein trbG  51.59 
 
 
298 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.0621057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  56.68 
 
 
338 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0169  P-type conjugative transfer protein TrbG  55.88 
 
 
278 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.227252  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.89 
 
 
314 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  43.47 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  45.2 
 
 
293 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  49.12 
 
 
266 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5215  P-type conjugative transfer protein TrbG  45.93 
 
 
355 aa  215  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5368  P-type conjugative transfer protein TrbG  37.72 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151828  normal  0.266795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2344  P-type conjugative transfer protein TrbG  31.66 
 
 
348 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  41.43 
 
 
296 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  39.52 
 
 
273 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  39.05 
 
 
284 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6507  conjugal transfer protein TrbG  37.12 
 
 
299 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0761422  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6630  conjugal transfer protein TrbG  37.12 
 
 
299 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4269  conjugal transfer protein TrbG  36.74 
 
 
299 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166546  normal  0.0145862 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  39.15 
 
 
279 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1666  P-type conjugative transfer protein TrbG  39.3 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  38.57 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0052  conjugal transfer protein TrbG  39.09 
 
 
295 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2230  conjugal transfer protein TrbG  35.83 
 
 
296 aa  135  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.938965  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  35.68 
 
 
273 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.32 
 
 
292 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2510  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.09 
 
 
260 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.108506  normal  0.474909 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.56 
 
 
293 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.36 
 
 
277 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.77 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.86 
 
 
255 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  32.2 
 
 
269 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  29.17 
 
 
284 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.7 
 
 
231 aa  86.3  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.63 
 
 
268 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.16 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.66 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  31.03 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.86 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6300  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.25 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  30.54 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5546  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.52 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0259324 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.5 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  27.88 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1527  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.8 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5192  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.8 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0164987  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  26.2 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  28.5 
 
 
250 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.89 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  28.04 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0859  hypothetical protein  63.64 
 
 
161 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.58 
 
 
305 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  23.39 
 
 
260 aa  61.6  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.17 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>