108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0014 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0014  conjugal transfer outer membrane protein TraH  100 
 
 
259 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0026  conjugal transfer outer membrane protein  41.54 
 
 
262 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08207  conjugal transfer outer membrane protein TraH  38.21 
 
 
255 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5022  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  33.59 
 
 
265 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0116672  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7529  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.57 
 
 
305 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.110766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6499  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  30.36 
 
 
276 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0159  hypothetical protein  31.08 
 
 
250 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0177  hypothetical protein  31.53 
 
 
250 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4439  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  31.03 
 
 
267 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0454  putative type IV secretion system protein VirB9  28.09 
 
 
278 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2651  putative type IV secretion system protein VirB9  26.91 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0400031  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0168  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.02 
 
 
281 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.313192 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5003  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.62 
 
 
285 aa  99  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341175  normal  0.712653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1143  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.35 
 
 
257 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4196  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.1 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258229  normal  0.907108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1760  putative type IV secretion system protein VirB9  27.27 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4847  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.32 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3319  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.32 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0210  type IV secretion system protein VirB9  28.41 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.332036  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0061  type IV secretion system protein VirB9  27.17 
 
 
289 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1680  type IV secretory pathway, VirB9 component  26.43 
 
 
306 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.338486 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0056  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.17 
 
 
289 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0250  Type IV secretory pathway AvhB9 protein  25.41 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.729526 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6399  P-type conjugative transfer protein VirB9  28.69 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5820  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.12 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4172  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28 
 
 
269 aa  88.6  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4340  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.65 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413275  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0044  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.73 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1104  hypothetical protein  27.8 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4371  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  28.19 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5080  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.54 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.494537 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0037  cmgB9  27.17 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0683  P-type conjugative transfer protein VirB9  26.32 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4557  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.68 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.630159  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9813  type IV secretion protein AvhB9  26.05 
 
 
269 aa  82  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1481  P-type conjugative transfer protein VirB9  25.71 
 
 
296 aa  82  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6212  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  27.93 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0737983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0865  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.4 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6331  P-type conjugative transfer protein VirB9  27.5 
 
 
292 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3981  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.85 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.813501  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0787  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.45 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4253  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3814  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.65 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.204788 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5236  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.28 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385034  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3646  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.42 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0387032 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7351  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.97 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280027 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0219  type IV secretion system protein, VirB9  25.6 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0114  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.26 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6154  type IV secretion system protein VirB9  23.96 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208035  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0175  P-type conjugative transfer protein VirB9  24.12 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.455783  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a017  conjugal transfer protein TraK/VirB9  23.44 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0742  type IV secretion system protein VirB9  25 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0043  type IV secretion system protein VirB9  27.19 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4755  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.94 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0021  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.74 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1187  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  26.82 
 
 
231 aa  62  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8220  type IV secretion system protein VirB9  22.18 
 
 
292 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.514909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0005  type IV secretion system protein VirB9  21.27 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5456  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25.7 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0200156 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3527  type IV secretion system protein VirB9  21.81 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0896  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.57 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2447  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.03 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2478  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.5 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.197669  normal  0.278704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2316  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.55 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012474  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2825  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.61 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4561  conjugal transfer protein TrbG  26.59 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.843427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3859  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.96 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0174658  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5384  conjugal transfer protein TrbG  24.73 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0585815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0148  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  25 
 
 
334 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51257  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0096  pilx9 protein  23.3 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164234  normal  0.522922 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5490  conjugal transfer protein TrbG  25.43 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26878  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9650  conjugal transfer protein TrbG  25.42 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0266012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1147  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.89 
 
 
293 aa  48.9  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9259  conjugal transfer protein TrbG  25.43 
 
 
296 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0501  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.57 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741964  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8325  conjugal transfer protein TrbG  27.17 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000831167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1186  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.82 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3549  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.82 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1324  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.56 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141371  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4202  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  24.79 
 
 
337 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250287  normal  0.746968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3220  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.15 
 
 
342 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000858475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0691  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.53 
 
 
338 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2576  conjugal transfer lipoprotein TrbG  23.5 
 
 
334 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515987  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2275  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.14 
 
 
266 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0310  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.52 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4238  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  21.72 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4696  P-type conjugative transfer protein TrbG  26.09 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1712  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.66 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000367277  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1476  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.12 
 
 
342 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278158  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0734  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  23.08 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.515891  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3699  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.94 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1842  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.57 
 
 
339 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.254623  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0430  P-type conjugative transfer protein TrbG  22.12 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127006  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2358  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.04 
 
 
333 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104041  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3498  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.04 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35640  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.08 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1290  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.58 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6570  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  22.52 
 
 
293 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2354  P-type conjugative transfer protein TrbG  21.71 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1005  P-type conjugative transfer protein TrbG  23.32 
 
 
328 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>