231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
341 aa  703    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  47.04 
 
 
342 aa  352  7e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  47.34 
 
 
342 aa  351  8e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  47.63 
 
 
342 aa  350  1e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  39.29 
 
 
348 aa  291  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  39.82 
 
 
355 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.93 
 
 
339 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.15 
 
 
339 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.23 
 
 
338 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.03 
 
 
339 aa  175  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.54 
 
 
345 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.57 
 
 
344 aa  149  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  31.67 
 
 
349 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  29.12 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  28.16 
 
 
287 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  27.61 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.71 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  29.65 
 
 
287 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  28.32 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.7 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.95 
 
 
341 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  31.73 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  25.14 
 
 
357 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  25.07 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  26.5 
 
 
372 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.35 
 
 
337 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  27.92 
 
 
556 aa  99.4  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  29.25 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  24.93 
 
 
363 aa  95.9  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  25.29 
 
 
363 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.35 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.22 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.19 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.57 
 
 
358 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  29.15 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  29.15 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  27.88 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  23.71 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.46 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  23.71 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  24.2 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  24.86 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  20.23 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0599  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.32 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1128  uroporphyrinogen decarboxylase  27.03 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320103  decreased coverage  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.06 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.11 
 
 
343 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  22.41 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  22.41 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  20.73 
 
 
617 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  24.89 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1200  uroporphyrinogen decarboxylase  25.62 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  24.24 
 
 
351 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  26.23 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0866  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
328 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770341  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
345 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  22.41 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0626  uroporphyrinogen decarboxylase  23.53 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464405  normal  0.107991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  24.91 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  26.2 
 
 
401 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  21.65 
 
 
380 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  26.34 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  22.41 
 
 
355 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  23.66 
 
 
351 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  23.81 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  22.28 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  28.9 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  20.72 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  23.79 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  27.17 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  23.79 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  22.75 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
353 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2386  methylcobamide:CoM methyltransferase-related protein  23.31 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  26.01 
 
 
346 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  22.91 
 
 
352 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  25.73 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  24.34 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  25.73 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  23.55 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  25.73 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  24.23 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  22.18 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  25.85 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  24.62 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  24.34 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  26.79 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  23.14 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>