46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0836 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
287 aa  577  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  93.03 
 
 
287 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  92.68 
 
 
287 aa  541  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  39.3 
 
 
293 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.14 
 
 
342 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.02 
 
 
348 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.23 
 
 
342 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  28.22 
 
 
296 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.23 
 
 
342 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.16 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.75 
 
 
355 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.9 
 
 
338 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.68 
 
 
339 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.95 
 
 
339 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.18 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.97 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.35 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.92 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  27.17 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.64 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.68 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  28.74 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.03 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  28.74 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.65 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  28.16 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  24.4 
 
 
556 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.95 
 
 
363 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  25.28 
 
 
372 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.6 
 
 
348 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.05 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  23.94 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.45 
 
 
373 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  23.84 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  23.92 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  25.15 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  27.81 
 
 
409 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.21 
 
 
337 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  23.2 
 
 
448 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  24.18 
 
 
365 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.85 
 
 
358 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.92 
 
 
343 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  22.86 
 
 
368 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  22.38 
 
 
355 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  25.17 
 
 
355 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>