280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1005 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
345 aa  705    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  60.97 
 
 
310 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  55.59 
 
 
341 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  45.59 
 
 
339 aa  317  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  46.61 
 
 
338 aa  315  8e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  47.65 
 
 
339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  35.21 
 
 
338 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  36.42 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  34.31 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.01 
 
 
344 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.94 
 
 
367 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.93 
 
 
342 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.22 
 
 
342 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.32 
 
 
342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  31.25 
 
 
348 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.86 
 
 
348 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  28.74 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.54 
 
 
341 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.79 
 
 
355 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  27.19 
 
 
363 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  26.32 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  26.24 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  30.5 
 
 
319 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  26.02 
 
 
372 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  24.64 
 
 
357 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.7 
 
 
375 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.38 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  27.04 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  27.27 
 
 
556 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.42 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  24.66 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  24.86 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  24.73 
 
 
361 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.78 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  26.74 
 
 
448 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  24.73 
 
 
402 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  21.74 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  24.19 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  23.03 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.71 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  23.55 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  23.41 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  23.35 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  24.42 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  23.12 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  24.5 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  24.93 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  34.21 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.24 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  24.57 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  25.21 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  23.71 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  23.8 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  23.99 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.52 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  24.29 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  23.41 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  25 
 
 
617 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  26.29 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  28.57 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  23.56 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  22.35 
 
 
364 aa  72.8  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  24.65 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  23.16 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  25.11 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  23.43 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  23.53 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  22.92 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.11 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  20.4 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  20.98 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  26.07 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  24.71 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  25.4 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  23.66 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  24.91 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  25.12 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  25.76 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  23.31 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  22.88 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  22.79 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  23.12 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  24.04 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  21.85 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  23.92 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  22.41 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  22.43 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.8 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  22.84 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  22.6 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  23.01 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  26.7 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  23.8 
 
 
340 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  22.57 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  26.03 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  23.7 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  22.47 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>